Genome Analysis Tools - Sakakibara Lab


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春日大輔のとある1日

8:30 登校

今日はとことん実験!気合の早起きで実験室へ直行。

※榊原研の実験室:パソコンがある創想館4Fの研究室とは別に、32棟1Fに実験室があります。学部3年生のときに生命情報実験を行ったお馴染みの場所です。

エントランス(?)です。ここではRNA班用のメダカを飼育しています(阿部くんがエサをあげています)。また、パソコンが3台置いてあり、4Fの研究室と同じ環境で作業ができます。

実験部屋です。実験机は4台あります。榊原研では全員が実験をするわけではないので、ほぼ1人1台の実験台を広々と使えます。

8:45 実験開始

次世代シークエンサー用のサンプル調整もいよいよ大詰め。今日は電気泳動、ゲルの切り出し、ゲルの溶出の繰り返しを2回行う他、夜には以前に調整した別のサンプルのサンガーシークエンシングも行う予定。ボリューム満点だけど頑張ろう!

11:30 昼食

2回目の電気泳動の時間を利用して昼食を食べに創想館4Fの研究室へ。実験中のときは時間の制約のために早飯/遅飯になり、研究室の人と一緒には食べられず一人飯になることも(T_T) ストップウォッチは手放せません。

※榊原研の研究室:創想館4Fの415がメインの研究室です。こちらも1人1台の机とパソコンが用意されているので、ゆったりとしたスペースで研究ができます。

ちなみに入り口にはこのようなお食事用(?)デスクがあります。カップ麺+白飯+野菜ジュースが春日の基本スタイル(食費約100円/日)。節約節約。。。

12:10 実験再開

ストップウォッチが鳴る前に実験室に到着。今日は食後の昼寝もできません(>_<)次世代シークエンサー用の試薬はどれも高価なので、ミスが無いように集中!(とか言って実は結構ミスしてます涙)

14:30 ソフトボール大会に出場

次世代シークエンサー用のサンプル調整が終わり、サンガー用のシークエンス反応も仕掛けたので、4Fに戻って運動着に着替えてグラウンドへ。今日は久々に打線爆発の予感!?

※ソフトボール大会:理工学部では1年を通じてソフトボール大会が開催されています。

18:00 4Fに戻ってちょっと研究

ひとまず4Fへ帰還。冷蔵庫にストックしてあるチョコレートを頬張りながら自分の研究デスクでPCのキーボードを乱れ撃ち!。。。と思いきやいつの間に爆睡なんてことも汗

※榊原研の研究スタイル:榊原研では実験(Wet)と情報解析(Dry)との両方を駆使して研究を行うことができます。(DryだけでもOKです)「せっかく”生命情報”と名の付く学科に入ったのだからWetもDryもやりたい!」「実験は苦手だけどコンピュータとかプログラミングとか好きかも。。。」という方にはもってこいの研究室です。

20:00 再び実験室へ

シークエンス反応が終わったようなので、シークエンサーにかけるための準備をします。今日は32サンプル、急げ急げ。。。

21:00 今度は4Fの実験室へ

21:00から予約を入れておいたので、早速シークエンス開始。結果は明朝に出ます。

※4Fの実験室:榊原研の向かい側にも実験室があります。ここは生命情報学科の共用実験室で、他の研究室の人も使っています。サンガーシークエンサーをはじめ、実は午前中に行ったゲルの切り出しを行ったときもここに来ています。

21:30 またまた32棟の実験室へ

まだまだ終わらない1日。。。本日最後には、今日完成した次世代シークエンサー用サンプルを確認するために、大腸菌の形質転換を行います。ちょいちょいある待ち時間を利用して、今日行った実験内容をノートにメモしておきます。

※実験ノート:実験で行ったことは実験ノートに書いておきます。同じ実験を何度もやることが多いので、一度しっかり書いておけば、後は昔のノートを見ながら、前回と違うところだけメモすればOKです。その他、実験機器が出すデータや写真を貼り付けたり、保管しておくサンプルの名称をメモしたりもします。実験のプロトコルは基本的に英語で、実験用のキットに付属しているものやweb上からダウンロードしたしたものを利用しますが、初めのうちは先輩が教えてくれるので英語があまり読めなくても安心です(汗)

23:00 片付け

お、終わった。。。実験台の片付け、サンプルの整理、実験器具の洗浄などを行って急いで片付け。終電が近づいている!

23:30 下校

片付けを終えて時計をみると、乗りたい電車到着まであと10分。。。これはヤバい!矢上〜日吉駅のアップダウンを猛ダッシュ!大学滞在時間13時間...お疲れさまでした♪

[注]こんなに忙しい日は稀ですので笑

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